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Rmarkdown: comunicação, transparência e reprodutibilidade

Ricardo de Oliveira Perdiz

Fev 2024

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Ricardo de Oliveira Perdiz

Pós-doutorando (PRONAT UFRR)

ricoperdiz@gmail.com

ricardoperdiz.com

@ricoperdiz

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R Markdown fornece uma estrutura de autoria unificada para ciência de dados, combinando seu código, seus resultados e seus comentários em prosa1

(1) https://r4ds.had.co.nz/r-markdown.html

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Comunicação

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Comunicação

Colaboração

4 / 24

Comunicação

Colaboração

Ambiente para se fazer ciência

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E daí?

5 / 24

E daí?

POR QUÊ?

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Transparência

6 / 24

Transparência

Disponibilidade dos dados

6 / 24

Transparência

Disponibilidade dos dados

Reutilização de dados

6 / 24

Transparência

Disponibilidade dos dados

Reutilização de dados

Reprodutibilidade

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Funcionalidades

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Tomada de decisão

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Formatar referências == Pesadelo 👻🤦🤦🤦👻

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Em Rmarkdown,

a SOLUÇÃO

é

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Buscar a referência

## To cite the MASS package in publications use:
##
## Venables, W. N. & Ripley, B. D. (2002) Modern Applied Statistics with
## S. Fourth Edition. Springer, New York. ISBN 0-387-95457-0
##
## A BibTeX entry for LaTeX users is
##
## @Book{,
## title = {Modern Applied Statistics with S},
## author = {W. N. Venables and B. D. Ripley},
## publisher = {Springer},
## edition = {Fourth},
## address = {New York},
## year = {2002},
## note = {ISBN 0-387-95457-0},
## url = {https://www.stats.ox.ac.uk/pub/MASS4/},
## }
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Compilar um arquivo .bib

## @Book{,
## title = {Modern Applied Statistics with S},
## author = {W. N. Venables and B. D. Ripley},
## publisher = {Springer},
## edition = {Fourth},
## address = {New York},
## year = {2002},
## note = {ISBN 0-387-95457-0},
## url = {https://www.stats.ox.ac.uk/pub/MASS4/},
## }
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Escrever em Rmarkdown

----
author: "R. Perdiz"
bibliography: bib.bib
----
## Material e métodos
Utilizamos a função `lda()` do pacote MASS [@MASS] para efetuar uma análise discriminante.
## Referências
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Material e métodos

Utilizamos a função lda() do pacote MASS (Venables & Ripley, 2002) para efetuar uma análise discriminante.

Referências

[1] W. N. Venables and B. D. Ripley. Modern Applied Statistics with S. Fourth. ISBN 0-387-95457-0. New York: Springer, 2002. https://www.stats.ox.ac.uk/pub/MASS4/.

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Demonstração

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Onde podemos aprender mais?

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Onde podemos aprender mais?

https://rmarkdown.rstudio.com/

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Onde podemos aprender mais?

https://rmarkdown.rstudio.com/

https://quarto.org/

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Disciplina

Tópicos especiais - Rmarkdown

comigo!

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